位湄洲里永福街二三巷十六號，廟後方以中山路相隔為仿巴洛克式街屋。天后宮是旗山的「媽祖廟」，相傳建於清嘉慶年間，為旗山人信仰活動的中心。
主祀「天上聖母林默娘」，左祀「境主公」，右祀「註生娘娘」。鎮殿媽左右配祀有左相右相、左判右判、「千里眼」「順風耳」，還有福德正神與婆祖母。座下有山神坐騎—「虎爺」。每年農曆三月二十三日媽祖誕辰，依例舉行會祭典，每三年擴大慶祝。
天后宮主要結構為二殿二廂，坐西朝東，屬於閩南傳統廟宇風貌。二殿，即前殿與正殿，兩殿之間隔以天井，左右有過廊，廊邊築以高牆與廂房相隔。兩殿之前各有一對龍柱，單龍蟠附，線條簡單，屬於早期龍柱的規格。前殿有一對方型石柱，刻有歐體楷書，為本區現存最早書法遺跡。
牆壁為磚造，屋架除石柱外，為木材結構，有樑、扥木、瓜柱、吊筒、斗拱、藻井、彩繪，皆為閩南型制，其木材亦為唐山福杉。
屋頂主脊，如燕尾翹起，曲線流暢，有展翼淩空之勢。正殿脊頂飾以雙龍拜三仙，兩端配以丹鳳朝元，廂房則為左龍右鳳，脊肚配置動物及人物，脊垂牌頭為神仙故事，皆以剪黏構成，甚為華麗。
左外牆鑲有嘉慶二十二年重立的乾隆四十四年「奉憲嚴禁羅漢腳惡習碑記」，廟內左右牆亦分別鑲有道光四年重立的「嘉慶二十一年興建天后宮碑記」及道光二十四年立的「重修天后宮碑記」，皆為旗山最珍貴的史料。
